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Chromatin Dynamics and Cell Proliferation

 

 

 

 

 

 

 

Positions:

The group is currently raising and Master- , Ph.D- students, as well as postDocs, are encouraged to apply.

 

Poste MCF en Biostatistiques :

 

Génomique de la Chromatine chez les Eucaryotes (LBME/CBI)

 

Notre thème de recherche porte du la génomique du chromosome, au travers du développement d'approches statistiques dans le traitement des données de séquençage à haut débit (ou Next Generation Sequencing (NGS)). Ce type de données permet notamment de révéler des aspects et/ou mécanismes moléculaires clés concernant l'organisation structurale et fonctionnelle des génomes eucaryotes. En particulier, l'équipe Cuvier du Laboratoire de Biologie Moléculaire Eucaryote (LBME) souhaite, dans le contexte du futur CBI, mettre en place des procédures d'analyses statistiques permettant d'étudier des aspects fonctionnels et structuraux variés. Nous nous intéressons particulièrement à l'organisation fonctionnelle et structurale des génomes vis à vis de processus aussi variés que la transcription et l'expression des gènes impliquant des mécanismes de régulations post-transcriptionnels, ou bien la réplication et/ou la réparation de l'ADN. A ces fins, nous avons déjà conduit un grand nombre d'analyses de données NGS concernant l'expression (RNASeq, DGE, GRO-Seq etc.), la liaison des protéines à la chromatine (ChIP-Seq), le positionnement des nucléosomes (MNase-Seq) comme déterminants de l'accessibilité, ainsi que le traitement de données appelées « Hi-C » qui permettent de représenter la structure génomique en 3D. Cette thématique de recherche vise notamment, dans le contexte du futur CBI, à servir de base d'analyses pour d'autres équipes travaillant sur des processus définis et/ou impliquant des facteurs spécifiques.

Aussi, une mission importante du candidat consistera à pouvoir développer des outils statistiques de traitement de ces données NGS, sur la base du savoir-faire de l'équipe et notamment vis à vis des autres thématiques du CBI dans le domaine de la chromatine et de la génomique fonctionnelle.

 

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Moléculaire Eucaryote
UMR 5099

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